軟件介紹

SnapGene特別版是一款專業(yè)的DNA序列分析軟件，方便用戶對(duì)各種DNA圖譜進(jìn)行全面的分析和修改，支持分析酶切位點(diǎn)、標(biāo)簽、啟動(dòng)子、終止子和復(fù)制子等質(zhì)粒原件，還能夠?qū)��?nèi)容導(dǎo)出為其他的格式，SnapGene能夠讓DNA的分析變得可視化，幫助專業(yè)人員更加深入了解DNA。

SnapGene特別版軟件特色

輕松保存記錄：

SnapGene中的每個(gè)DNA操作都會(huì)自動(dòng)記錄下來(lái)，因此您可以準(zhǔn)確地看到自己所做的事情并檢索祖先構(gòu)建體的序列。

邊走邊學(xué)：

如果您不熟悉克隆或特定技術(shù)，那么直觀直觀的SnapGene界面可幫助您了解其工作原理。

更快獲得結(jié)果：

您實(shí)驗(yàn)室中的人員將不再浪費(fèi)時(shí)間使用有缺陷的克隆程序，并且會(huì)在第一時(shí)間開始獲得正確的構(gòu)建體。

保留更好的實(shí)驗(yàn)室記錄：

SnapGene會(huì)自動(dòng)生成每個(gè)序列編輯和克隆過(guò)程的記錄，因此即使在實(shí)驗(yàn)室成員離開后，您也不會(huì)丟失構(gòu)建方式的蹤跡。

走快點(diǎn)：

得益于SnapGene的直觀用戶體驗(yàn)，強(qiáng)大的可視化和仿真工具以及錯(cuò)誤預(yù)防功能，您公司的研發(fā)活動(dòng)將更加迅速。

無(wú)縫實(shí)施：

SnapGene支持多種文件格式；因此，您的科學(xué)家可以完全切換到SnapGene而不會(huì)丟失數(shù)據(jù)，或者可以繼續(xù)與SnapGene一起使用舊版軟件而不會(huì)發(fā)生沖突。

設(shè)計(jì)更好的程序：

準(zhǔn)確設(shè)計(jì)和模擬克隆過(guò)程，測(cè)試復(fù)雜的項(xiàng)目，及時(shí)發(fā)現(xiàn)錯(cuò)誤，并在第一時(shí)間獲得正確的結(jié)構(gòu)。

可視化您的過(guò)程：

當(dāng)您看到自己在做什么時(shí)，克隆會(huì)更容易；直觀的界面為您提供無(wú)與倫比的工作可視性，簡(jiǎn)化了通常很復(fù)雜的任務(wù)。

自動(dòng)記錄您的工作：

SnapGene可以自動(dòng)執(zhí)行文檔編制，因此您不必這樣做；查看并分享產(chǎn)生最終質(zhì)粒的每個(gè)序列編輯和克隆過(guò)程。

SnapGene特別版功能介紹

一、想象

1、DNA可視化

查看DNA序列的多個(gè)視圖。

地圖 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 歷史

自定義酶位點(diǎn)，特征，引物，ORF，DNA顏色等的顯示。地圖可以是圓形或線性格式。

使用雙鏈模式查看酶位點(diǎn)，具有翻譯，引物和DNA顏色的特征。單鏈模式顯示具有彩色特征的緊湊概覽。

從一系列酶組中選擇。剪切網(wǎng)站可以顯示為數(shù)字或行，按名稱或頻率排序。

按名稱，位置，大小，顏色，方向性或類型對(duì)帶注釋的要素列表進(jìn)行排序。復(fù)選框在緊湊或完全展開的顯示之間切換。

按名稱，長(zhǎng)度，顏色，結(jié)合位點(diǎn)，方向性或解鏈溫度對(duì)雜交引物列表進(jìn)行排序。復(fù)選框在緊湊或完全展開的顯示之間切換。

查看DNA構(gòu)建體的自動(dòng)生成的圖形歷史記錄。祖先序列可以作為單獨(dú)的文件恢復(fù)

2、大序列支持

瀏覽染色體大小序列。

查看 · 搜索 · 縮放

利用SnapGene的高效數(shù)據(jù)處理功能，掃描具有數(shù)千種注釋功能的大型DNA序列。

使用專有的MICA算法立即在染色體內(nèi)找到序列。

使用多功能控件調(diào)整縮放系數(shù)和顯示區(qū)域。

3、蛋白質(zhì)可視化

查看蛋白質(zhì)序列的多個(gè)視圖。

地圖 · 序列 · 屬性 · 特征 · 歷史

自定義區(qū)域，站點(diǎn)，鍵和序列顏色的顯示。

使用具有相關(guān)特征的1-或3個(gè)字母的氨基酸代碼查看蛋白質(zhì)序列。

查看蛋白質(zhì)的分子量，消光系數(shù)，等電點(diǎn)和氨基酸組成。可以對(duì)蛋白質(zhì)的選定部分進(jìn)行相同的分析。

按名稱，位置，大小，顏色或類型對(duì)帶注釋的功能列表進(jìn)行排序。復(fù)選框在緊湊或完全展開的顯示之間切換。

查看自動(dòng)生成的蛋白質(zhì)序列圖形歷史記錄。祖先蛋白質(zhì)或DNA序列可以作為單獨(dú)的文件再生。

4、直觀的序列編輯

輕松編輯DNA和蛋白質(zhì)序列。

標(biāo)準(zhǔn)編輯 · DNA結(jié)束

進(jìn)行插入，刪除，替換和大小寫更改。復(fù)制并粘貼序列時(shí)，會(huì)自動(dòng)傳輸功能。

編輯線性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯。

5、序列顏色編碼

將選定的DNA或氨基酸序列設(shè)置為十種顏色之一。

給兩條DNA鏈或蛋白質(zhì)序列著色。顏色在Map和Sequence視圖中都可見(jiàn)。

6、特征注釋

自動(dòng)注釋常用功能，或手動(dòng)注釋新功能。

自動(dòng)特征檢測(cè) · 手動(dòng)特征注釋

使用SnapGene廣泛的數(shù)據(jù)庫(kù)查找DNA序列中的常見(jiàn)特征。您選擇的其他功能可以添加到自定義數(shù)據(jù)庫(kù)中。

選擇DNA或蛋白質(zhì)序列的一部分，并使用靈活的GenBank兼容控件注釋特征。

二、模擬

1、限制性站點(diǎn)指標(biāo)

確認(rèn)限制性網(wǎng)站適合克隆。

獨(dú)特性 · 甲基化敏感性 · 特殊性質(zhì)

以粗體顯示獨(dú)特的限制性位點(diǎn)，或選擇自動(dòng)定義的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶組。

不要被愚弄，因?yàn)橄拗菩晕稽c(diǎn)被Dam，Dcm或EcoKI甲基化阻斷。SnapGene將自動(dòng)用星號(hào)標(biāo)記該站點(diǎn)。

利用工具提示來(lái)避免有問(wèn)題的限制網(wǎng)站。

2、限制性克隆

可視化克隆過(guò)程的所有方面。

如果您已經(jīng)考慮過(guò)程，則模擬只需幾秒鐘。如果克隆過(guò)程存在設(shè)計(jì)缺陷，則可以捕獲并糾正錯(cuò)誤。

3、PCR

模擬標(biāo)準(zhǔn)PCR。

使用您自己的引物，或要求SnapGene自動(dòng)設(shè)計(jì)引物。產(chǎn)品文件在其歷史記錄中存儲(chǔ)模板和引物。

4、重疊延伸PCR

通過(guò)重疊延伸PCR融合片段

最多可組裝八個(gè)碎片。選擇要連接的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。

5、引物定向誘變

使用誘變引物進(jìn)行定點(diǎn)誘變。

選擇誘變引物，按下按鈕查看修飾的質(zhì)粒。歷史顏色突出了突變。

6、網(wǎng)關(guān)?克隆

模擬網(wǎng)關(guān)? BP克隆或LR克隆，或兩者在同一時(shí)間。

為方便起見(jiàn)，提供了常見(jiàn)的供體向量和目的向量。選擇要組裝的片段，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。

7、吉布森大會(huì)?

通過(guò)融合多達(dá)八個(gè)片段或通過(guò)將多達(dá)八個(gè)片段插入向量來(lái)模擬Gibson Assembly。Gibson Assembly是一種流行的無(wú)縫克隆方法。

選擇要融合的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。線性化的載體可以通過(guò)酶消化或反向PCR產(chǎn)生。

8、IN-FUSION ?克隆

通過(guò)在向量中插入最多八個(gè)片段來(lái)模擬Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一種非常通用的方法，可用于創(chuàng)建無(wú)縫基因融合。

選擇要融合的片段及其方向，SnapGene將設(shè)計(jì)引物。線性化的載體可以通過(guò)酶消化或反向PCR產(chǎn)生。

9、TA和GC克隆

通過(guò)TA或GC克隆捕獲PCR產(chǎn)物。

選擇傳統(tǒng)的TA克隆或高效GC克隆。

為方便起見(jiàn)，提供了常見(jiàn)的TA克隆載體和Lucigen的GC克隆載體。

10、退火Oligos

退火兩個(gè)寡核苷酸形成雙鏈產(chǎn)物。

使用簡(jiǎn)單的控件添加突出限制克隆。

三、避免錯(cuò)誤

使用SnapGene，確保構(gòu)造符合您的要求，并確認(rèn)您獲得了所需的序列。

1、閱讀基因融合的框架

確保構(gòu)造中的已轉(zhuǎn)換要素符合框架。

鏈接翻譯 · 警告信息

使用“序列”視圖可以快速查看兩個(gè)已翻譯的要素是否在框架中。如果是這樣，翻譯鏈接在同一行。如果不是，則翻譯在單獨(dú)的行上。

2、與參考序列對(duì)齊

使用強(qiáng)大的對(duì)齊工具檢查實(shí)際構(gòu)造是否與模擬構(gòu)造匹配。

地圖概述 · 序列詳細(xì)信息

請(qǐng)參閱對(duì)齊序列與參考序列匹配的位置的概述，以及存在差異的位置。

四、自動(dòng)錄制

SnapGene自動(dòng)記錄操作以創(chuàng)建圖形歷史記錄，并將祖先結(jié)構(gòu)存儲(chǔ)在最終文件中。

1、全面的“撤銷”能力

幾乎撤消任何操作。

不要害怕嘗試使用SnapGene文件 - 回溯您的步驟很容易。

2、歷史和嵌入式祖先

查看構(gòu)造的圖形歷史記錄。

單擊操作以突出顯示親本和產(chǎn)物序列的相關(guān)部分，或單擊PCR引物名稱以查看引物序列。

單擊歷史記錄樹中的祖先以重新生成該祖先序列文件，包括其注釋和克隆歷史記錄。

3、歷史色彩

使用可選的歷史記錄顏色來(lái)標(biāo)識(shí)序列的最新更改。

詳細(xì)了解構(gòu)建體的組裝方式，包括結(jié)扎的粘性末端。

五、擁有你的數(shù)據(jù)

SnapGene允許您根據(jù)需要閱讀和共享文件，同時(shí)保持對(duì)數(shù)據(jù)的完全控制。

1、安全文件管理

將SnapGene文件保存在所需的位置。

使用熟悉的安全操作系統(tǒng)來(lái)存儲(chǔ)和整理SnapGene文件。

2、從其他格式導(dǎo)入

閱讀許多常見(jiàn)的文件格式。

不僅可以導(dǎo)入DNA序列，還可以導(dǎo)入注釋和注釋。我們將繼續(xù)開發(fā)進(jìn)口商，以確保您不會(huì)被鎖定為專有文件格式。

3、導(dǎo)出為標(biāo)準(zhǔn)格式

將序列，地圖或凝膠圖像轉(zhuǎn)換為標(biāo)準(zhǔn)格式，以便與其他軟件一起使用。

將序列導(dǎo)出為GeNBAnk或FASTA格式。將地圖或模擬瓊脂糖凝膠導(dǎo)出為常見(jiàn)的圖像格式。

4、使用SnapGene Viewer共享數(shù)據(jù)

將SnapGene格式的文件發(fā)送給可以下載免費(fèi)SnapGene Viewer的同事或客戶。

只需將文件與鏈接一起發(fā)送到SnapGene Viewer即可。收件人將能夠看到地圖，序列和注釋，就像在完整的SnapGene界面中一樣。

5、對(duì)于開發(fā)人員

要將SnapGene整合到您的數(shù)據(jù)分析或?qū)嶒?yàn)室管理軟件中，請(qǐng)聯(lián)系我們以獲取有關(guān)如何讀取和寫入SnapGene文件的信息。

六、轉(zhuǎn)換文件格式

開放式信息交換至關(guān)重要，因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了讀取和導(dǎo)出常見(jiàn)文件格式的選項(xiàng)。

從其他格式導(dǎo)入時(shí)，目標(biāo)不僅是捕獲DNA序列，還捕獲注釋和注釋

使用幫助

一、調(diào)整配置

1、打開SnapGene設(shè)置文件

SnapGene設(shè)置文件位于：

蘋果系統(tǒng)：

?/庫(kù)/首選項(xiàng)/ com.gslbiotech.snapgene.plist

視窗：

C：\ Users \用戶名\ AppData \漫游\ GSLBiotech \ SnapGene.ini

Linux的：

?/ .snapgene /的Settings.ini

2、禁用軟件更新

要?jiǎng)h除所有“檢查更新”菜單選項(xiàng)并禁用自動(dòng)更新，請(qǐng)?jiān)?ldquo;更新”類別中將“禁用”設(shè)置為“true”。

3、轉(zhuǎn)移源功能

要確保在克隆時(shí)將“源”功能傳輸?shù)疆a(chǎn)品，請(qǐng)?jiān)?ldquo;文件”類別中將“transferSourceFeatures”設(shè)置為“true”。

二、顯示或隱藏酶

1、顯示酶

要顯示酶，請(qǐng)單擊Enzymes → Show Enzymes。

2、隱藏酶

要隱藏酶，請(qǐng)單擊酶→隱藏酶。

3、使用側(cè)工具欄切換酶可見(jiàn)性

單擊側(cè)工具欄中的“顯示酶”按鈕也可用于在顯示和隱藏所有酶之間切換。

三、選擇一套酶套裝

Map和Sequence視圖中顯示的酶可以從預(yù)定義或定制酶組列表中選擇。

1、選擇一套酶套裝

要選擇酶組，請(qǐng)單擊酶→使用酶組→[...]。

2、使用側(cè)工具欄選擇酶組

或者，通過(guò)單擊側(cè)工具欄中的“ 顯示酶 ”（限制性位點(diǎn)圖標(biāo)）菜單按鈕來(lái)選擇酶組。

四、手動(dòng)選擇酶

通過(guò)名稱或編輯現(xiàn)有酶組或使用搜索條件手動(dòng)選擇酶。

1、選擇一套酶套裝

要選擇現(xiàn)有酶組，請(qǐng)單擊酶→選擇酶，然后在選擇：列表中選擇酶組名稱。

2、按名稱選擇酶

要在所選酶組中進(jìn)行搜索，請(qǐng)?jiān)谒阉骺蛑休斎朊该�稱。

或者，單擊酶名稱以選擇它。

3、添加到酶組

要將選定的酶添加到Chosen Enzymes設(shè)置，請(qǐng)單擊Add→按鈕。

要將原始集中的所有酶添加到Chosen Enzymes集，請(qǐng)單擊Add All→按鈕。

4、從酶套裝中取出

要從Chosen Enzymes設(shè)置中刪除選定的酶，請(qǐng)單擊“ 刪除”按鈕或按Delete鍵。

要從Chosen Enzymes設(shè)置中刪除所有酶，請(qǐng)單擊Remove All按鈕。

5、按標(biāo)準(zhǔn)選擇酶

要根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)選擇酶，請(qǐng)單擊“ 選擇”復(fù)選框。符合所選條件的酶將在“ 選擇自：”列表中突出顯示

要指定從中選擇酶的酶組，請(qǐng)單擊“從菜單中選擇”按鈕。

來(lái)指定由其中所選擇的酶將減少定義的酶集合，單擊酶切割菜單按鈕。

要指定剪切站點(diǎn)的數(shù)量，請(qǐng)?jiān)谒�選框中鍵入一個(gè)數(shù)字。如果之前未指定，則可以在右側(cè)指定剪切站點(diǎn)區(qū)域。

要指定酶懸垂類型設(shè)置的酶，請(qǐng)單擊“ 懸垂”菜單按鈕。

要指定識(shí)別序列長(zhǎng)度，請(qǐng)單擊“ 識(shí)別序列”菜單按鈕。

要僅指定具有回文，不間斷或非簡(jiǎn)并識(shí)別序列的酶，請(qǐng)單擊相應(yīng)的框。

安裝教程

1、首先在本頁(yè)面下載SnapGene特別版文件包，然后使用壓縮軟件解壓文件，雙擊exe程序打開安裝

2、安裝路徑可以直接默認(rèn)或者是安裝在非中文路徑中

3、接下來(lái)點(diǎn)擊i agree即可

4、勾選需要的擴(kuò)展功能，點(diǎn)擊next進(jìn)行下一步

5、接下來(lái)直接點(diǎn)擊install開始安裝

6、等待片刻即可安裝成功，取消勾選運(yùn)行程序，點(diǎn)擊finish完成安裝

7、將本站提供的文件中crack中的SnapGene.exe復(fù)制至程序的安裝目錄即可