常見的硬盤分區格式主要有一下幾種：

（1）fat16格式。Fat16是ms-DOS和早期的windows 95操作系統使用的磁盤分區格式。它采用16位文件分配表，單個邏輯驅動器的容量最大支持2gb，許多操作系統都支持這種分區格式，如dos、windows系列以及linux等。Fat16分區格式最大可以管理2 gb的邏輯驅動器，擴展分區可以大于2 g，但每個分區最多只能有65 536個鏃。隨著硬盤或分區容量的增大，每個鏃所占的空間將越來越大，導致硬盤空間的浪費。由于分區表容量的限制，fati6創建的分區越大，磁盤上每個鏃的容量也越大，造成的浪費也越大。

（2）fat32格式。Fat32格式采用32位的文件分配表，磁盤的管理能力大大增強，突破了fat16的2gb分區容量限制。將硬盤按fat32格式分區后，可以將一個大硬盤定義成一個分區而不必分為幾個邏輯驅動器使用，大大方便了對磁盤的管理。Fat32使用的鏃比fat16小，能有效地節約硬盤空間。目前使用的windows98/2000/xp等操作系統以及linux部分版本都支持fat32格式。

（3）ntfs。Ntfs是windows nt內核的系列操作系統支持的、一個特別為網絡和磁盤配額、文件訪問權限等管理安全特性設計的磁盤格式其安全性和穩定性好，在使用中不易產生文件碎片。隨著以nt為內核的windows 2000/xp的普及，ntfs被廣泛使用。Ntfs也是以鏃為單位來存儲數據文件，但ntfs中鏃的大小并不依賴于磁盤或分區的大小，鏃尺寸的縮小不但降低了磁盤空間的浪費，而且還減少了產生磁盤碎片的可能ntfs支持文件加密管理功能，可用戶提供更高層次的安全保證。

Windows2000/xp/win7在文件系統上是向下兼容的，可以很好地支持fat16/fat32和ntfs，其中ntfs是windowsnt/2000/xp/win7專用格式，能充分有效地利用磁盤空間，支持文件及壓縮、具備更好的文件安全性。如果計算機只安裝windows2000、xp、win7，最好選擇ntfs文件格式，其中win7系統的安裝盤必須為ntfs格式，其他盤可以為fat32格式；如果安裝包括windows 98在內的多重引導系統，則系統引導區（c盤)必須為fat16或fat32，否則不支持多重引導，其他分區的文件系統可以為ntfs格式。